25.04.2024
Národné kompetenčné centrum pre HPC a Fakulta chemickej a potravinovej technológie STU v Bratislave pripravujú populárno-náučnú prednášku na tému Úvahy o úlohe vysoko výkonných počítačov (HPC) a grafických procesorov v genómovej analýze DNA.
Prednáška je súčasťou série populárno-náučných prednášok o zaujímavých príkladoch využitia vysokovýkonného počítania.
Využitie „open source“ bioinformatických nástrojov pre genómovú analýzu na HPC môže byť problematické z hľadiska ich slabej paralelizácie na úrovni jednej analyzovanej DNA vzorky. Paralelizácia týchto nástrojov na HPC je možná tak, že sa analýzy spustia na viacerých vzorkách. Využívaniu HPC dnes konkurujú grafické procesorov a karty, na ktorých je možná paralelizácia už na úrovni jednej vzorky. Dobrý riešením by preto mohlo byť umožnenie kombinovaného využitia
Podujatie sa bude konať 14. mája 2024 od 16.00 – 17.30 hod. v priestoroch Fakulty chemickej a potravinárskej technológie STU, Radlinského 9, Bratislava (2. poschodie nad hlavným vchodom do budovy, priestory knižnice).
Prednášajúci:
Ing. Miloslav Karhánek, PhD., Biomedicínske centrum SAV, v. v. i.
Prednášky sa konajú v príjemnej a neformálnej atmosfére pri káve. Nahrávky z vybraných prednášok budú následne k dispozícii na YouTube kanáli Národného kompetenčného centra pre HPC a v našom archíve pre tých, ktorí sa nemohli zúčastniť osobne.
Zdroj: Prednášky – EUROCC@NSCC