Poslaním SOMED2013 je prezentovať vedecké úspechy a pokroky urobené vo výskume v oblasti mikrobiálnej ekológie a jej súvislosti k chorobám. SOMED2013 poskytuje komplexné vedecké fórum pre všetky zúčastnené strany z oblasti mikrobiálnej ekológie v zdraví a chorobe. Trojdňová konferencia je podujatie pre vedcov, výskumníkov a poskytovateľov technológií. Súčasťou konferencie bude tiež poskytovať platformu pre vedecké výmeny a diskusie medzi delegátmi z celého sveta a to nielen z akademickej sféry ale aj z  priemyslu.

Hlavnou témou budú  aktuálne pokroky v klinickej mikrobiológii, diétne modulácie z GIT ekosystému, vplyv antibiotík na mikrobiálnu ekológiu, interakcie hostiteľskej mikróby a úloha biofilmov v zdraví a chorobe. To je cieľom SOMED2013, ďalej rozvíjať porozumenie komplexnosti mikrobiálnej ekológie vo vzťahu k chorobám, a tiež aby preskúmala, ako premeniť výsledky výskumu na praktické nástroje a aplikácie s cieľom podporovať zdravie a predchádzať chorobám. Kongres je jedinečnou príležitosťou na stretnutie medzinárodne uznávaných vedcov,  ktorí posúvajú vpred chápanie role mikrobiálnej ekológie v zdraví a chorobe.